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Enregistrement W4413113029 · doi:10.1128/spectrum.00749-25

Comparison of the analytical and clinical sensitivities of 34 rapid antigen tests with prevalent SARS-CoV-2 variants of concern during the COVID-19 pandemic in the UK

2025· article· en· W4413113029 sur OpenAlexfundno aff
Rachel L. Byrne, Rachel S. Owen, Ghaith Aljayyoussi, Caitlin Greenland-Bews, Konstantina Kontogianni, Anushri Somasundaran, Dominic Wooding, Christopher T. Williams, Margaretha de Vos, Richard Body, Emily R. Adams, Camille Escadafal, Thomas Edwards, Ana I. Cubas-Atienzar, Kate Buist, Karina Clerking, Lorna Finch, Helen R. Savage, Caitlin R. Thompson, A. Joy Allen, Julian Braybrook, Peter Buckle, Paul Dark, Kerrie Davis, Adam J. Gordon, Daniel Lasserson, Clare Lendrem, Andrew Lewington, Mary Logan, Massimo Micocci, Brian K. Nicholson, Rafael Perera, Graham Prestwich, David Price, Charles Reynard, John Simpson, Valerie Tate, Philip Turner, Mark H. Wilcox

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research Council CanadaNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Pandemic2019-20 coronavirus outbreakBetacoronavirusVirologyCoronavirus InfectionsCoronavirusBiologyMedicineOutbreakInfectious disease (medical specialty)Internal medicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antigen-detection rapid diagnostic tests (Ag-RDTs) have become a central pillar for the management of coronavirus disease worldwide due to their speed and ease of use and are now being developed for use in other emerging outbreaks. Like other viruses, severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is subject to rapid mutation as it spreads, and new variants of concern (VOCs) emerge frequently, posing a significant challenge for the detection of newer, highly mutated variants. It is, therefore, important that the performance of Ag-RDTs is regularly evaluated, particularly in outbreak scenarios where rapid diagnostics are key to limiting disease spread. Here, we present a comprehensive evaluation of the analytical and clinical sensitivities of 34 commercially available Ag-RDTs with five SARS-CoV-2 VOCs, all of which were highly prevalent in the UK at various times between 2019 and 2023. This study highlights the importance of regular evaluation of the Ag-RDT performance, with several Ag-RDTs demonstrating a reduced performance with some VOCs. We conclude that a regular performance evaluation through our proposed pipeline, combined with a broad consensus approval threshold across global organizations, is essential to maintaining the effectiveness of Ag-RDTs as a disease management tool during outbreaks.IMPORTANCEAntigen-detection rapid diagnostic tests (Ag-RDTs) came to global prominence during the coronavirus disease pandemic, where they offered a quick and simple at-home diagnostic, which could be used to manage disease spread. A major ongoing challenge for the broad use of Ag-RDTs is the speed at which new SARS-CoV-2 variants emerge, each of which has the potential to reduce the performance of available Ag-RDTs. As Ag-RDTs are explored for use in other viral disease outbreaks, pipelines for the regular evaluation of test performance are essential for ensuring that Ag-RDTs can be employed effectively. Here, we have developed a robust pipeline for the large-scale evaluation of commercially available Ag-RDTs against several major SARS-CoV-2 variants, which can be adapted and applied to other emerging outbreaks to ensure that test performance is maintained as a virus evolves.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,481

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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