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Enregistrement W4413113779 · doi:10.1111/jipb.70019

Clonal longevity and the enigmatic flowering of woody bamboos are associated with rates of protein evolution

2025· article· en· W4413113779 sur OpenAlexfundno aff
Xin Wang, Zhi‐Hua Zeng, Pengfei Ma, Yunlong Liu, Huaying Sun, Hong Wang, Hong Mā, Li D, Wei Zhou

Notice bibliographique

RevueJournal of Integrative Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesZhejiang UniversityUniversity of TorontoNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésLongevityBiologyBotanyPlant evolutionEvolutionary biologyGenomeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

) vary widely across the tree of life. In plants, both life-history traits and GC-biased gene conversion (gBGC) are thought to contribute to this variation, although disentangling their individual contributions remains a challenge. Using information on variation in life-history traits and molecular data in 148 species from Poaceae subfamilies Bambusoideae (mostly woody) and Pooideae (exclusively herbaceous), we investigated the relative importance of modes of reproduction and the non-selective forces of gBGC on protein evolutionary rates between the two subfamilies. Elevated rates of protein evolution associated with relaxed purifying selection were more evident in woody bamboos than in Pooideae and were better explained by reproductive modes than by traits that are likely proxies of effective population size. Although gBGC slightly reduced protein evolutionary rates in both subfamilies, its contribution had only a limited effect on molecular divergence between the groups. Forward simulations generally supported our empirical results on the influence of reproductive mode on selection and gBGC. Our findings from two sister lineages of the grass family provide evidence for association between protein evolution and life-history traits governing reproductive mode and enhance understanding of molecular evolution in plants with contrasting reproductive strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,293

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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