Cell-Specific Transcriptomic and Mito-Nuclear Imbalance in Lungs Under Intermittent Hypoxia in Adult Male Mice
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Obstructive sleep apnea and its characteristic intermittent hypoxia (IH) are widely recognized as significant contributors to various pulmonary diseases, including asthma, pulmonary arterial hypertension, fibrosis, and chronic obstructive pulmonary disease. While single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has provided valuable insights into cell-type-specific responses to IH, previous studies have primarily focused on post-hypoxic recovery states, leaving immediate molecular responses during active IH exposure unexplored. To address this critical knowledge gap, we investigated real-time transcriptional responses to IH at single-cell resolution in lung tissue using male mice (n=3/group) exposed to either normoxia or IH (30 cycles/h, nadir 6% O 2 , 12 h/day) for 14 days, with tissue collection during active IH exposure. Our analysis revealed pronounced cell-type-specific transcriptional reprogramming, particularly in airway smooth muscle cells (ASMC), arterial endothelial cells (AEC), and lymphatic endothelial cells (LEC). These changes were characterized by enrichment in pathways related to epithelial-to-mesenchymal transition (ASMC, LEC), myogenesis (ASMC), and antioxidant defenses (AEC, LEC). Most cell types demonstrated substantial upregulation of genes encoding mitochondrial complex I-IV proteins and TCA cycle enzymes accompanied by a decreased expression of genes encoded by mitochondrial DNA that was markedly present in LEC, AEC, and cells of the alveolar-capillary unit, revealing a mito-nuclear imbalance. These findings provide novel insights into the immediate cellular responses to IH, showing previously uncharacterized metabolic reorganization that may underlie the development of IH-related pulmonary complications. This improved understanding of early molecular events during active IH exposure advances our knowledge of sleep apnea-related lung pathologies and may inform future therapeutic strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».