DNA barcode assessment of Xanthium section Xanthium cockle burrs in Australia
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Notice bibliographique
Résumé
Abstract Xanthium cockle burrs are invasive weeds in many countries, affecting local ecosystems and agriculture. All Xanthium in Australia are naturalised weeds from multiple overseas sources, but their taxonomic identities are contentious. In particular, species identities of four burr varieties or “complexes” under Xanthium section Xanthium in Australia are unclear. These complexes, commonly referred to as “Noogoora”, “Californian”, “Hunter”, and “South American” burr, are regarded as either varieties of a single species ( Xanthium strumarium ) or four separate species in the section. To genetically determine the species identities of these complexes in Australia, we compared their chloroplast DNA barcodes to reference sequences of vouchered Xanthium species reported by Tomasello (2018). We barcoded 173 plants from 26 sites consisting of single complex burrs and 175 plants from sites containing mixed burr complexes. Single complex sites contained either of two DNA barcode clades. One clade consisting of Noogoora and Californian burrs matched reference sequences of X. chinense . The second clade consisting of Hunter and South American burrs matched X. orientale . Genetic exchange between these two species in Australia was partially evident at some sites containing sympatric complexes or putative hybrids. Reference X. strumarium sequences were unmatched to the DNA barcodes of specimens sampled in Australia, and subsequently, we advise against future claims to a historical presence of this species in Australia. Our findings are significant for taxonomic treatment of Xanthium species in Australia and for consideration of source-specific biological controls of these weeds.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle