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Enregistrement W4413129176 · doi:10.3390/v17081114

The Differences in the Evolutionary Dynamics of MERS and SARS Coronaviruses

2025· article· en· W4413129176 sur OpenAlexaff
Yushan Ding, Jiameng Liu, Jamal S. M. Sabir, Xinyuan Cui, Xuejuan Shen, Nahid H. Hajrah, Mohamed Morsi M. Ahmed, Meshaal J. Sabir, Onaizan Godian Al-Zogabi, David M. Irwin, Yongyi Shen

Notice bibliographique

RevueViruses · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMiddle East respiratory syndrome coronavirusBiologyPhylogenetic treeCladeTransmission (telecommunications)Evolutionary biologyEvolutionary dynamicsZoologyMiddle East respiratory syndromeDipeptidyl peptidase-4OutbreakPhylogeneticsCoronavirusLivestockDiseaseVirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneticsGeneEcologyInfectious disease (medical specialty)MedicinePopulationEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SARS-CoV and MERS-CoV are two coronaviruses that have received significant attention due to their high pathogenicity and mortality rates in human populations. In this study, we compared their evolutionary dynamics to provide a One Health perspective on their differences in terms of the results of disease control. The phylogenetic network of SARS-CoVs showed that human isolates gathered into a “super-spreader” cluster and were distinct from civet isolates. In contrast, dromedary camel- and human-isolated MERS-CoVs were clustered together. Thus, most clades of MERS-CoV can infect humans, and MERS-CoVs seem to more easily spill over the animal-to-human interface. Additionally, the civet can be easily controlled, while the intermediate host (dromedary camels) of MERS-CoV is an important livestock species, so it is impossible to eliminate all animals. This further leads to difficulties in disease control in MERS. Although MERS-CoVs are endemic to dromedary camels in both the Middle East and Africa, human infections are mainly linked to the Middle East. The nucleotide sequences of the MERS-CoV receptor gen (dipeptidyl peptidase 4 (DPP4)) from 30 Egyptians, 36 Sudanese, and 34 Saudi Arabians showed little difference. These findings suggest that the observed disparities in MERS prevalence between populations in the Middle East and Africa may be more strongly attributed to inadequate disease surveillance and the limited camel-to-human transmission of clade C MERS-CoV in Africa, rather than variations in DPP4 gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,370
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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