Obesity- and Lipid-Related Traits May Causally Contribute to Sepsis-Associated Acute Kidney Injury
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: Acute kidney injury (AKI) is a major complication of sepsis resulting in substantial morbidity and mortality. We used genome-wide association study (GWAS) data together with Mendelian randomization (MR) analysis in multiple cohorts of different ancestries to identify traits potentially contributing to sepsis-associated AKI (Septic-AKI). DESIGN: Natural experiment and case-control study. SETTING: ICU patients, FinnGen ( finngen.fi ), and U.K. Biobank participants. PATIENTS: Adults with sepsis or septic shock. INTERVENTIONS: None. MEASUREMENTS AND MAIN RESULTS: We conducted a discovery GWAS in the U.K. Biobank by selecting, after quality control, 4584 European Septic-AKI patients as cases, and 7090 European sepsis patients without AKI as controls. Causal inference analyses using two sample MR combined these GWAS results with Integrative Epidemiology Unit Open Genome-Wide Association Studies results for 118 clinical risk factors and 386 metabolites and, separately, for 13 lipid classes from FinnGen GWAS results. We tested for replication of positive findings in two independent genotyped septic shock cohorts (Vasopressin and Septic Shock Trial [VASST] cohort n = 632 and Japanese Septic Shock Cohort [Chiba] cohort n = 536). Variants in the GALNTL6 gene were associated with Septic-AKI (rs149773593; odds ratio = 2.18; p = 3.0 × 10 -8 ) in U.K. Biobank patients. GALNTL6 is associated with cardiometabolic traits, which we then focused on. Increased body mass index was associated with increased serum creatinine in both septic shock cohorts ( p < 0.0001). Obesity and metabolic traits, most frequently related to very low-density lipoprotein, were identified as potentially causal contributors to Septic-AKI. Combining these GWAS results with FinnGen GWAS results identified associations with Septic-AKI, which replicated in both independent septic shock cohorts, for cholesterol ester ( p = 4.8 × 10 -44 ), lysophosphatidylcholine ( p = 8.5 × 10 -54 ), phosphatidylcholine ( p = 2.7 × 10 -39 ), and phosphatidylethanolamine ( p = 2.1 × 10 -28 ). CONCLUSIONS: For Septic-AKI, GWAS identified a novel genetic susceptibility locus ( GALNTL6 ), which is also associated with cardiometabolic traits. We then further found that obesity- and lipid-related traits are possible contributors to the pathogenesis of Septic-AKI.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».