Neurodevelopmental disorder mutations in the exchange factor DENN/MADD disrupt activation of Rab GTPases
Notice bibliographique
Résumé
DENN/MADD (mitogen-activated protein kinase-activating death domain), a differentially expressed in normal and neoplastic cells (DENN) domain-containing protein functions in membrane trafficking. DENN domain-bearing proteins have guanine nucleotide exchange factor activity toward Rab GTPases. Here, we identify Rab GTPase substrates for DENN/MADD using a cell-based assay involving DENN domain-mediated recruitment of Rab substrates to mitochondria. We confirmed known interactions of DENN/MADD with Rab3A, Rab3B, Rab3C, Rab3D, and Rab27B and identified four new potential substrates, Rab8B, Rab15, Rab26, and Rab37, results confirmed with biochemical experiments. Mutations in the DENN domain of DENN/MADD result in diverse pathophysiological manifestations, ranging from predominant neurological dysfunction to a multisystem disorder. Structural analysis using AlphaFold suggested that these mutations affect DENN/MADD's interaction with Rab GTPases. Introducing such mutations into DENN/MADD's DENN domain influenced the mitochondrial recruitment of Rabs. This study identifies new DENN/MADD protein interactions and cellular pathways, the disruption of which results in human disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».