Dominance of toxigenic Clostridioides difficile strains and the appearance of the emerging PCR ribotype 955 in hospitals in Silesia, Poland
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Toxigenic strains of Clostridioides difficile are the leading cause of healthcare-associated bacterial infections in Poland. In the Silesian Voivodeship, with 4.5 million inhabitants, the incidence of C. difficile infection (CDI) in 2023 reached 65.1/100,000, slightly down from 70.0/100,000 in 2022. This study aimed to investigate the occurrence of toxigenic C. difficile ribotypes in hospitalized patients in Silesia. Materials and methods A total of 130 stool samples from patients with confirmed antibiotic-associated diarrhea were tested. Multiplex PCR detected genes for GDH, toxins A/B, binary toxin CDT, and 16S rDNA. Ribotyping was performed by capillary PCR, and antibiotic susceptibility was tested with ETEST for 10 antibiotics. Results Multiplex PCR confirmed the presence of all toxins (A+B+CDT+) in 97 isolates. Six strains (6%) represented ribotype 955 (RT955), first reported in Poland in 2023. RT027 remained dominant (60%, n = 78). All isolates were susceptible to vancomycin, while 4% (5/130) showed metronidazole resistance. Conclusion RT027 remains prevalent among CDI cases in Silesia. The emergence of RT955, closely related to a UK epidemic strain, suggests a possible shared origin and epidemiological link.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».