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Enregistrement W4413228984 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-qt1rr

Long-Range Interactions in High-Dimensional Neural Network Potentials: A Benchmark Study for Small Organic Molecules

2025· preprint· en· W4413228984 sur OpenAlexafffund
Nguyễn Thiên Phúc Từ, A. Knoll, Jörg Behler, Christopher N. Rowley

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueMachine Learning in Materials Science
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésElectrostaticsIntermolecular forceStatistical physicsCutoffChemistryTest setDensity functional theoryArtificial neural networkDipolePhysicsMolecular physicsMoleculeQuantum mechanicsComputational chemistryComputer scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many machine learning potentials (MLPs) rely on representations of the total energy in terms of the positions of the atoms in their local environment, using either a cutoff radius or a limited number of message-passing layers. This restricts their ability to model long-range intermolecular interactions accurately. This limitation can be addressed by explicitly incorporating long-range electrostatic and dispersion interactions into the MLP framework. In this paper, we investigate the impact of augmenting high-dimensional neural network potentials (HDNNPs) with both electrostatic and dispersion corrections on the prediction of gas-phase intermolecular interactions between small organic molecules. We employ a machine learning-based charge equilibration (QEq) scheme to model electrostatics and the Machine-Learning eXchange-hole Dipole Moment (MLXDM) model to account for dispersion. The resulting model, CombineNet, integrates these long-range terms with short-range atomic energies trained on density functional theory (DFT) data and achieves a low mean absolute error (MAE) of 0.59~kcal/mol (root mean square error (RMSE) of 3.38~meV/atom) against CCSD(T)/CBS benchmarks on the DES370K test set. Notably, electrostatic interactions derived from Hirshfeld charges tend to underestimate long-range effects, whereas the Minimal Basis Iterative Stockholder (MBIS) charges yield more accurate interaction trends. For reliable modeling of molecular dimers, the training set must capture both the dissociation limit and the transition region near the cutoff radius. For reliable modeling of molecular dimers, the training set must cover the full range of interest of intermolecular distances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,467
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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