HIV cure research contributions from Africa in the last three decades
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: The HIV epidemic in Africa is characterized by extensive viral subtype diversity and human genetic heterogeneity which influence disease outcomes; amidst the co-morbidities that modulate HIV reservoirs and immune responses. This paper provides an overview of the quantity and spectrum of HIV cure research in context of the contributions made by African scientists toward HIV cure related research in Africa. Methods: Using a hybrid environmental scan, we searched the Treatment Action Group website to identify registered HIV cure-related observational and interventional studies between 1995-2024. To identify published papers related to HIV or SIV latency, we searched PubMed for articles with HIV or SIV in the title PLUS terms related to virus latency in the title or in medical subject headings (MeSH); and downloaded results in PubMed format in a text file. We used an R script which checked NCBI to identify articles which cited the original paper that first described the HIV reservoir in 1995, restricting to only those within the query result. This was repeated using loop functions until we obtained all articles directly or indirectly linked to the original paper. Results: Overall, we show an increasing trend of HIV cure-related observational and interventional studies globally; with the least number of studies in Africa. The PubMed query retrieved 7122 HIV cure-related published articles, as at 23 July 2024; of which 2820 were directly or indirectly linked to understanding the HIV reservoir. Of the 2916 articles with first author affiliation country determined, only 52 (0.02%) had affiliations from African institutions. Of the 1955 articles with last author affiliation country determined, only 43 (0.02%) had affiliations from institutions in Africa. The majority of articles with first or last authors from African institutes were descriptive clinical studies of HIV infection, with less than ten studies specifically addressing HIV latency. Conclusion: Scale up of HIV cure research in Africa remains critical to hasten achievement of the global goal of an end to the AIDS epidemic by 2030. There is a need to bridge the technical, infrastructural and technological divides and address constraints in funding and capacity; to promote discovery, characterization and application of promising innovative therapies including immunotherapies and cell and gene therapies towards attaining an effective, durable, affordable and scalable HIV cure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,030 | 0,086 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,027 | 0,035 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,006 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,015 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».