Divergence, hybridization, and diversification in an eastern North American willow syngameon
Notice bibliographique
Résumé
Present-day patterns of genetic diversity and phylogeography are influenced by various factors, with hybridization and historical climate changes often pivotal. The Salix genus presents an ideal case study for these dynamics because of the large numbers of hybridizing species. This study investigates the intricate hybridization dynamics within a quadra-species hybrid syngameon that includes Salix nigra and three closely related species: S. amygdaloides, S. gooddingii, and S. caroliniana. Employing sequence capture techniques, we analyzed 6646 975 single nucleotide polymorphisms (SNPs) across 265 individuals from 18 populations to investigate population structure, genetic diversity, phylogenetic relationships, demography, and hybridization patterns. Significant hybridization was observed between S. nigra and its close relatives. Hybridization can account for up to 31% of the genome in hybrid-zone populations of S. nigra; nucleotide diversity is up to 56% higher than in allopatric populations, thereby strongly shaping population structure and genetic diversity. Demographic analyses suggest a model of ongoing gene flow throughout the speciation process. Species distribution modeling indicated that currently allopatric species likely had overlapping distributions in the past, which allowed past hybridization. This study illuminates how historical glaciation in North America influences the timing and location of hybridization and, in turn, shapes contemporary geographic patterns of genetic diversity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».