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Enregistrement W4413258224 · doi:10.1093/biolre/ioaf119

Alpha-ketoglutarate modulates the reprogramming of mitochondrial and nuclear DNA methylation during the earliest stages of the bovine preimplantation embryo development

2025· article· en· W4413258224 sur OpenAlexaff
Jéssica Ispada, Camila Bruna de Lima, Aldcejam Martins da Fonseca-Junior, Érika Cristina dos Santos, Hélène Martin, Pablo J. Ross, Marc‐André Sirard, Marcella Pecora Milazzotto

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyReprogrammingBlastocystDNA methylationEpigeneticsEmbryo cultureEpigenomicsMitochondrial DNAMethylationDNA demethylationEmbryoGeneticsCell biologyAndrologyEmbryogenesisDNACellGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the preimplantation embryonic development, metabolic and epigenomic remodeling are crucial events that can be significantly impacted even by minor environmental changes. Right after fertilization, nuclear deoxyribonucleic acid (DNA) undergoes demethylation, reaching the lowest levels at the 8-16 cell stage, marking the onset of mitochondrial metabolism and genome activation. This coincides with "de novo" DNA methylation events guiding cell lineage differentiation at the blastocyst stage. High levels of α-ketoglutarate (AKG) in cancer and pluripotent stem cells promote a more undifferentiated state, acting as a cofactor for ten-eleven translocation (TET) demethylases. In this study, we examined the metaboloepigenetic adaptations from AKG supplementation during the in vitro culture in a bovine model. Bovine embryos were produced in vitro and culture until Day 4 in the presence or not of 4 mM of AKG. After AKG discontinuation, embryos remained in culture until Day 7 for blastocyst analysis. AKG during the early stages of development led to the expected increase in the levels of TET family enzymes, resulting in a decrease in nuclear 5mC levels. Additionally, the blastocysts derived from the AKG group exhibited reduced mitochondrial activity in the inner cell mass, along with increased methylation levels of mitochondrial DNA. Integrative analysis of DNA methylation and transcription revealed low correlation between these two omics, with a higher effect of AKG treatment on DNA methylation than the ribonucleic acid content. These results indicate that minor metabolic alterations early in development, such as AKG supplementation, have a significant impact on the embryo's metabolism and molecular control, compromising the epigenetic reprogramming.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,137
Score d'incertitude au seuil0,178

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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