Reconstructing the Phylogenetic Relationships of Scomberomorus spp.: Evolutionary History from Whole-Genome Data
Notice bibliographique
Résumé
The genus Scomberomorus (mackerels) includes several important marine fish species of high economic value in global fisheries and aquaculture, particularly across Asia. However, due to the large number of species and their morphological similarity, traditional taxonomy has been ambiguous, hindering efforts in genetic improvement and resource conservation. In recent years, with the advancement of high-throughput sequencing technologies, phylogenetic studies have entered the "whole-genome era." This paper provides a comprehensive review of the latest developments in reconstructing the phylogeny of Scomberomorus , highlighting the application of whole-genome data in species classification, lineage delimitation, speciation mechanisms, and evolutionary timescales. Case studies on farmed populations in Asia are also discussed, evaluating the genetic structure of hatchery and released stocks relative to wild lineages, and proposing lineage-based population optimization strategies. Further analysis indicates that phylogenetic research contributes not only to the identification of genetic resources and resistance traits but also offers scientific support for molecular breeding, broodstock selection, and genetic improvement. The paper concludes by recommending expanded global sampling, multi-omics integration, and the application of phylogenetic findings in aquaculture management, aiming to bridge foundational evolutionary research with practical breeding applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».