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Enregistrement W4413313235 · doi:10.1371/journal.pgen.1011828

Two pairs of CACNA1I (CaV3.3) variants with opposite effects on channel function cause neurodevelopmental disorders of varying severity

2025· article· en· W4413313235 sur OpenAlexaff
Yousra El Ghaleb, Monica L. Fernández‐Quintero, Marta Campiglio, Petronel Tuluc, Ann-Sophie Höing, Fanny Kortüm, M. Mahdi Motazacker, Iris E. Jansen, Mariet W. Elting, Astrid S. Plomp, Anna-Lena M. Fischer, Victoria Mok Siu, Kerstin Kutsche, Bernhard E. Flucher

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesAustrian Science FundDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyGeneticsFunction (biology)Bioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The T-type voltage-gated calcium channel CaV3.3 is expressed in GABAergic neurons of the thalamic reticular nucleus (TRN), where its pacemaking activity controls sleep spindle rhythmogenesis during the non-rapid eye movement (NREM) phase of natural sleep. Previously, we established CACNA1I, the gene coding for CaV3.3, as a disease gene for neurodevelopmental disease with or without epilepsy. Here we report three newly identified activation-gate-modifying heterozygous missense variants of CACNA1I, found in four unrelated patients with neurodevelopmental disease with or without seizures. One of these variants, p.(Met1425Val), is an amino-acid substitution at the same position as previously published variant p.(Met1425Ile). Notably, the other two variants studied here are also a pair of two different substitutions of the same amino acid: p.(Ala398Val) and p.(Ala398Glu). By using site-directed mutagenesis, voltage-clamp electrophysiology, computational modelling of neuronal excitability, and structure modelling, we found that the two substitutions of M1425 both result in a gain of channel function including left-shifted voltage-dependence of activation and inactivation, slowed inactivation and deactivation kinetics, and increased neuronal excitability. Remarkably, the two substitutions of A398 show opposite effects on channel function. While substitution A398E leads to a gain of channel function, A398V results in decreased current density, accelerated gating kinetics, and a decreased neuronal excitability. The lack of seizures in the two independent p.(Ala398Val) patients correlates with the absence of increased neuronal excitability in this variant. This is the first report of a gate-modifying CaV3.3 channel variant with partial loss-of-function effects associated with developmental delay and intellectual disability without seizures. Our study corroborates the role of CaV3.3 dysfunction in the etiology of neurodevelopmental disorders. Moreover, our data suggest that substantial gain-of-function of CaV3.3 leads to the development of seizures, whereas both gain- and loss-of-function variants of CACNA1I can cause neurodevelopmental disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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