Variability in biofilm formation dynamics by <i>Salmonella enterica</i> isolated from animal-origin foods, plant-based foods, environment, clinical, and unspecified food sources: a 3-day in vitro study in tryptic soy broth at ambient temperature
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial biofilm production is linked to its adaptive capacity to environments throughout its lifecycle. This study aimed to assess the variability in biofilm formation (BF) dynamic by Salmonella enterica and to explore the potential impact of the cell’s prior history, primarily shaped by strain and its isolation source. In vitro BF of 141 S. enterica strains isolated from animal-origin foods, plant-based foods, unspecified food sources, the environment, and clinical cases, was evaluated using the crystal violet assay at 25 °C for up to 72 h. Kruskal–Wallis test was used to assess the effect of time, source, and strain. The Aryani method was used to characterize microbial response variability. The BF capacity of S. enterica strains ranged from 0.07 to 2.3, 0.07 to 2.7, and 0.06 to 2.7OD595nm at 24, 48, and 72 h, respectively. At 24 h (66.0%; 93/141) and 48 h (56.0%; 79/141), most isolates were classified as nonbiofilm producers, while at 72 h, the majority were weak biofilm producers (39.7%; 56/141). Time, strain, and isolation source significantly influenced BF, with an overall increase in BF occurring over time, and clinical strains being the highest biofilm producers. Strain to strain variability was the highest contributor to the total variance ([Formula: see text] = 0.18OD595nm 2, [Formula: see text] = 0.23OD595nm 2, [Formula: see text] = 0.26OD595nm 2). Analysis of variability between and within isolation source groups revealed the highest variability among clinical isolates ([Formula: see text] = 1.08OD595nm 2, [Formula: see text] = 1.36OD595nm 2, [Formula: see text] = 1.38OD595nm 2). Although BF was statistically associated with the strain and its isolation source, the high variability observed within these factors suggests that they alone are insufficient to explain how the cell’s prior history influences BF. A more comprehensive undertanding on BF will require considering additional intrinsic and extrinsic factors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».