Site-Specific Changes in Cytosine Methylation in Promoters of the Genes Encoding the Membrane Subunits of Succinate Dehydrogenase During Germination of Maize Seeds
Notice bibliographique
Résumé
The cytosine methylation status of symmetric and asymmetric sites of promoters of the genes encoding the membrane-bound subunits C and D of succinate dehydrogenase (SDH) was assessed during the germination of maize (Zea mays L.) seeds, when the stored lipids were utilized and the glyoxylate cycle produced succinate. The results of bisulfite sequencing of the promoters of Sdh genes in maize scutella allowed us to determine the cytosine methylation status in the CG, CNG, and CNN sites. The observed site-specific changes in the cytosine methylation status of the Sdh3-1 and Sdh3-2 genes encoding the SDH subunit C indicate an important role in controlling their transcriptional activity. In contrast, no marked changes were observed in the methylation of promoters of the Sdh4 gene, encoding SDH subunit D. The analysis of changes in the activity of the CG, CNG, and CNN DNA methyltransferases revealed the redistribution of activity between CG, CNG, and CNN DNA methyltransferases toward an increase in the proportion of CG DNA methyltransferases. The locus-specific methylation dynamics of SDH membrane subunit promoters during maize germination have been demonstrated. It is concluded that the changes in the cytosine methylation status may play a role in the regulation of the expression of the Sdh genes in the course of the conversion of succinate formed in the glyoxylate cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».