Evaluation of Allplex™ GI-Parasite Assay—A Multiplex Real Time PCR for the Diagnosis of Intestinal Protozoa: A Multicentric Italian Study
Notice bibliographique
Résumé
Background: The microscopic examination of stool samples remains the reference method for the diagnosis of intestinal protozoal infections; however, this technique is time consuming and requires experienced and well-trained operators. Therefore, there is a growing interest in molecular diagnostic techniques, including commercial PCR assays. The aim of this multicentric study was to evaluate a commercial real-time PCR for the detection of intestinal protozoa in fecal samples. Methods: The samples were routinely examined using conventional techniques, such as macro- and microscopic examination after concentration, Giemsa or Trichromic stain, Giardia duodenalis, Entamoeba histolytica/dispar or Cryptosporidium spp. antigens research, and amoebae culture. The samples were frozen by the participating laboratories, retrospectively extracted and examined with one-step real-time PCR multiplex using the Allplex™ GI-Parasite Assay (Seegene Inc., Seoul, Korea). Results: A total of 368 samples were analyzed from 12 Italian laboratories. Compared to traditional techniques, the sensibility and specificity of the real-time PCR kit were as follows: 100% and 100% for Entamoeba histolytica, 100% and 99.2% for Giardia duodenalis, 97.2% and 100% for Dientamoeba fragilis, and 100% and 99.7% for Cryptosporidium spp., respectively. Conclusions: The Allplex™ GI-Parasite Assay exhibited excellent performance in the detection of the most common enteric protozoa.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».