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Enregistrement W4413342628 · doi:10.1073/pnas.2424203122

Minimizing and quantifying uncertainty in AI-informed decisions: Applications in medicine

2025· article· en· W4413342628 sur OpenAlexaff
Samuel D. Curtis, Sambit Panda, Adam Li, Haoyin Xu, Yuhang Bai, Itsuki Ogihara, Eliza O’Reilly, Yuxuan Wang, Lisa Dobbyn, Maria Popoli, Janine Ptak, Nadine T. Nehme, Natalie Silliman, Jeanne Tie, Peter Gibbs, Lan T. Ho‐Pham, Ngoc Bich Tran, Thach Tran, Tuan V. Nguyen, Ehsan Irajizad, Michael Goggins, Christopher L. Wolfgang, Tian‐Li Wang, Ie‐Ming Shih, Amanda N. Fader, Anne Marie Lennon, Ralph H. Hruban, Chetan Bettegowda, Lucy Gilbert, Kenneth W. Kinzler, Nickolas Papadopoulos, Bert Vogelstein, Joshua T Vogelstein, Christopher Douville

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilNational Institutes of HealthDepartment of Health and Aged Care, Australian Government
Mots-clésFalse positive paradoxComputer scienceNonparametric statisticsUncertainty quantificationSensitivity (control systems)Parametric statisticsFalse positives and false negativesVariable (mathematics)Set (abstract data type)Data miningMachine learningArtificial intelligenceAlgorithmStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AI is now a cornerstone of modern dataset analysis. In many real world applications, practitioners are concerned with controlling specific kinds of errors, rather than minimizing the overall number of errors. For example, biomedical screening assays may primarily be concerned with mitigating the number of false positives rather than false negatives. Quantifying uncertainty in AI-based predictions, and in particular those controlling specific kinds of errors, remains theoretically and practically challenging. We develop a strategy called multidimensional informed generalized hypothesis testing (MIGHT) which we prove accurately quantifies uncertainty and confidence given sufficient data, and concomitantly controls for particular error types. Our key insight was that it is possible to integrate canonical cross-validation and parametric calibration procedures within a nonparametric ensemble method. Simulations demonstrate that while typical AI based-approaches cannot be trusted to obtain the truth, MIGHT can be. We apply MIGHT to answer an open question in liquid biopsies using circulating cell-free DNA (ccfDNA) in individuals with or without cancer: Which biomarkers, or combinations thereof, can we trust? Performance estimates produced by MIGHT on ccfDNA data have coefficients of variation that are often orders of magnitude lower than other state of the art algorithms such as support vector machines, random forests, and Transformers, while often also achieving higher sensitivity. We find that combinations of variable sets often decrease rather than increase sensitivity over the optimal single variable set because some variable sets add more noise than signal. This work demonstrates the importance of quantifying uncertainty and confidence-with theoretical guarantees-for the interpretation of real-world data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,029
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,112
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,156

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0290,112
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,006
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0040,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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