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Enregistrement W4413352948 · doi:10.3390/microorganisms13081939

PapB Family Regulators as Master Switches of Fimbrial Expression

2025· review· en· W4413352948 sur OpenAlexafffund
Fariba Akrami, Hossein Jamali, Mansoor Kodori, Charles M. Dozois

Notice bibliographique

RevueMicroorganisms · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitut National de la Recherche ScientifiqueCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFimbriaOperonBiologyPilusComputational biologyGeneticsBacterial adhesinCell biologyGeneEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

operon, which encodes P fimbriae, a key virulence factor in urinary and systemic infections. One of the key regulators of P fimbriae is the transcriptional regulator PapB which plays a pivotal role as a master switch, not only by directing phase-variable expression of its own operon but also by influencing expression of heterologous fimbrial systems. This review explores the structural organization, biogenesis, and multi-tiered regulatory control of P fimbriae, with emphasis on PapB and homologous regulatory proteins such as SfaB, FocB, PixB, and PefB. Comparative genomics and phylogenetic analyses reveal that regulators belonging to the PapB family are evolutionarily conserved across π-fimbrial systems and also regulate other types of fimbriae. These regulators respond to epigenetic changes, host-derived signals, and global transcriptional cues to control levels of production of specific fimbriae in a bacterial population to dynamically modulate bacterial adhesion in different environmental niches. Optimally, understanding these mechanisms could lead to novel approaches to perturb PapB-family proteins and abrogate production of some types of fimbriae as a targeted strategy to prevent bacterial infections dependent on adherence mediated by PapB family regulators.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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