Thermal profiling of novel and known miRNAs during cold acclimation in Aedes aegypti
Notice bibliographique
Résumé
The disease vector, Aedes aegypti, can better survive low temperature exposure following cold acclimation. This plasticity may be contributing to this species' recent range expansion. However, the molecular mechanisms behind this ability remain unexplored. MicroRNAs (miRNAs) can drive rapid changed in gene expression and are known to regulate thermal plasticity in other animals. We used a bioinformatic approach to identify three novel miRNAs in Ae. aegypti. After acclimating adult female Ae. aegypti to cold (15 °C) and warm (25 °C) conditions, we used RT-qPCR to perform differential expression analysis on these novel miRNAs and four other miRNAs downregulated during diapause in another mosquito species. Two novel miRNAs, aae-miR-novel2 and aae-miR-novel3, were upregulated in cold-acclimated individuals. Two described miRNAs associated with lipid metabolism and reproduction, aae-miR-8-3p and aae-miR-13b-3p, were downregulated in the cold-acclimated group, suggesting these processes are affected during cold acclimation. Temperature alone can alter miRNA target genes, and the thermodynamic parameters used to predict miRNA targets are typically established assuming body temperatures relevant to endotherms, rather than those applying to poikilothermic ectotherms. Here, we instead tested for cold-influenced targets of miRNAs of interest, predicted to only become thermodynamically stable at 15 °C. This approach provides insight into the putative roles that these novel miRNAs could play in cold acclimation. Many predicted targets were involved in processes associated with insect low temperature survival, like ion homeostasis and membrane stability, while others suggest roles for understudied processes. Our results suggest that miRNAs play a regulatory role in mosquito thermal plasticity that deserves further attention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».