Leveraging the influenza sentinel surveillance platform for SARS-CoV-2 monitoring in Bangladesh (2020–2024): a prospective sentinel surveillance study
Notice bibliographique
Résumé
Background: There is limited global evidence on whether influenza sentinel surveillance platforms can be effectively adapted for long-term SARS-CoV-2 monitoring in low-resource contexts. We explored the utility of the hospital-based influenza sentinel surveillance (HBIS) platform for monitoring SARS-CoV-2 in Bangladesh by comparing SARS-CoV-2 detection in HBIS platform with national COVID-19 platform and assessing how its integration into influenza surveillance aligns with national trends. Methods: From March 2020 to December 2024, we analysed data from patients with severe acute respiratory infection (SARI) and influenza-like illness (ILI) enrolled in HBIS. Socio-demographic and clinical data were recorded, and nasopharyngeal and oropharyngeal swabs were tested for influenza and SARS-CoV-2 using rRT-PCR. Whole-genome sequencing was performed on a subset of SARS-CoV-2-positive samples. Data from national COVID-19 platform were obtained from the Directorate General of Health Services, Bangladesh, and were compared with HBIS platform data using epidemic curves and Pearson correlation analysis. Findings: = 0.86, P < 0.001). Sequencing of 234 SARS-CoV-2 strains detected the beta and delta variants in April and May 2021, respectively, and omicron subvariants circulating from 2022 to 2024, aligning with the national COVID-19 platform. Interpretation: SARS-CoV-2 positivity trends in HBIS platform closely aligned with the national COVID-19 platform, demonstrating its potential as a sustainable platform for COVID-19 monitoring. Our findings underscore the feasibility of influenza sentinel surveillance as an early warning system for future COVID-19 outbreaks or other respiratory viruses of pandemic concern in Bangladesh and similar settings. Funding: Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Atlanta, Georgia, USA (U01GH002259).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».