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Enregistrement W4413408982 · doi:10.1101/2025.08.21.671621

A disease-causing Isoleucyl-tRNA synthetase variant leads to altered protein complex formation and cellular stress response

2025· preprint· en· W4413408982 sur OpenAlexafffund
Han Gao, Flávio Bezerra de Araújo, Samuel Protais Nyandwi, Juan Pablo Padilla-Martinez, Rasangi Tennakoon, Hui Peng, Haissi Cui

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenMitacsUniversity of Toronto
Mots-clésTransfer RNAAminoacyl tRNA synthetaseDiseaseGeneticsBiologyFight-or-flight responseCell biologyComputational biologyMedicineRNAGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aminoacyl-tRNA synthetases are key enzymes in protein synthesis, as they catalyze the attachment of amino acids to their designated, cognate tRNAs. As such, mutations in aminoacyl-tRNA synthetases are associated with severe diseases, such as neurodevelopmental disorders. Many of these mutations occur in the catalytically active site or tRNA binding domains, however, others can affect domains associated with multisynthetase complex formation. Here, we investigate a disease-causing mutation in the UNE-L domain of Isoleucyl-tRNA synthetase ( IARS1 , IleRS), which mediates IleRS interactions within the multisynthetase complex. Interestingly, levels of the resulting protein were severely reduced in comparison to wildtype IleRS. While bulk protein synthesis and cell proliferation were not affected, the integrated stress response signaling pathway was altered. This change was exacerbated in low glucose medium, suggesting that mutant cells could respond differently to cellular stress. Our study hints at a possible underlying disease mechanism, where catalytic activity might not be affected but instead complex formation and protein stability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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