Anaerobic gut fungal community in ostriches ( <i>Struthio camelus</i> )
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Notice bibliographique
Résumé
Abstract Anaerobic gut fungi (AGF; Neocallimastigomycota) are crucial for the degradation of plant biomass in herbivores. While extensively studied in mammals, information regarding their occurrence, diversity, and community structure in nonmammalian hosts remains sparse. Here, we report on the AGF community in fecal samples of 13 domesticated ostriches. The ostrich (Struthio camelus) is an herbivorous, flightless, hindgut-fermenting member of the class Aves (birds). Illumina-based metabarcoding targeting the D2 region of the large ribosomal subunit (28S rRNA) revealed a uniform AGF community with low alpha diversity in the fecal samples. The community was mostly comprised of sequences potentially representing two novel species in the genus Piromyces, and a novel genus in the Neocallimastigomycota. Sequences affiliated with these novel taxa were absent or extremely rare in datasets derived from mammalian and tortoise samples, indicating a strong pattern of AGF-host association. One Piromyces strain (strain Ost1) was successfully isolated. Transcriptomics-enabled molecular dating analysis suggested a divergence time of ≈ 30Mya, a time frame in line with current estimates for ostrich evolution. Comparative gene content analysis between strain Ost1 and other Piromyces species from mammalian sources revealed a high degree of similarity. Our findings expand the range of AGF animal hosts to include members of the birds (class Aves), highlight a unique AGF community in the ostrich alimentary tract, and document the occurrence of a strong pattern of fungal–host association in ostriches, similar to previously observed patterns in AGF canonical mammalian hosts.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle