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Enregistrement W4413425595 · doi:10.1038/s41467-025-62953-x

Coordinated regulation of pH alkalinization by two transcription factors promotes fungal commensalism and pathogenicity

2025· article· en· W4413425595 sur OpenAlexaff
Xinhua Huang, Guang-Sheng Chen, Lei Wu, Yun Zou, Luyao Zhang, Shanshan Li, Kunlin Li, Zaijie Jiang, Yuping Zhang, Xiaoqing Chen, Winnie Shum, Junbiao Dai, Hexiang Huang, Munika Moses, Xianwei Wu, Yuanyuan Wang, Tong Jiang, Zhiyi He, Qing Guo, Wenwen Xue, Hao Li, Changbin Chen

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesUniversity of California, San FranciscoState Key Laboratory of Pathogen and BiosecurityNational Natural Science Foundation of ChinaNatural Science Foundation of Shanghai
Mots-clésCandida albicansTranscription factorBiologyCommensalismMutantRegulatorCorpus albicansCell biologyMicrobiologyPhenotypePhagolysosomeGeneEffectorRegulation of gene expressionGeneticsBacteriaPhagosomeIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As a clinically relevant opportunistic human fungal pathogen, Candida albicans is able to rapidly sense and adapt to changing microenvironments within the host, a process that is essential for its successful invasion and survival. Although studies have shown that the transcription factor Stp2 is the master regulator of environmental alkalinization, accumulating evidence supports a clear involvement of other participants in this adaptation process. Here, following a large-scale genetic screen, we identify the transcription factor Dal81 as an uncharacterized positive regulator of pH alkalinization in C. albicans. Dal81 influences the protein levels of Stp2. A mutant lacking DAL81 also fails to alkalinize both in vitro and in the phagolysosome, and this defective phenotype is further enhanced by deleting both factors in most cases. Notably, our results demonstrate that Dal81 physically interacts with Stp2 to co-regulate the expression of a broad set of downstream target genes related to metabolism of organic acids, oxoacids, carboxylic acids and amino acids. This coordinated regulation mode is required for the alkalinization process and plays a role in modulating commensalism and pathogenicity of C. albicans. Taken together, our findings elucidate the cooperative function of Dal81 with Stp2 in the nucleus to orchestrate the expression of downstream genes required for the survival and propagation of C. albicans in the host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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