Gut Microbiota and Short-Chain Fatty Acid Profiles in Facioscapulohumeral Dystrophy: Associations with Epigenetic Alterations
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Gut microbiota (GM) affects muscle homeostasis, and growing evidence indicates dysbiosis of GM may be a contributing factor in the pathogenesis of dystrophies. Furthermore, GM metabolites can interact with DNA methylation. Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) is the second common dystrophy with hypomethylation of DR1 and 5P regions of D4Z4 repeat on 4qter. OBJECTIVE: Considering alteration of GM may be a contributing factor, we investigated (i) GM alterations and (ii) the correlation of microbial-derived free fatty acids (FFAs) with methylation of DR1 and 5P regions in FSHD. METHODS: Twenty-eight FSHD patients and 28 gender-age-matched controls were included. GM characterisation was performed through 16S-rRNA sequencing. Methylation levels of DR1 and 5P regions were assessed by bisulphite sequencing. Faecal and circulating FFAs including short-chain fatty acids (SCFAs), medium-chain fatty acids (MCFAs) and long-chain fatty acids (LCFAs) were analysed with gas chromatography-mass spectrometry. RESULTS: FFAs in patients, while no correlation was identified in healthy controls. The severely affected patients exhibited a notable increase in the prevalence of Pasteurellaceae, while the FFA profile was similar among mild and severely affected patients. This is the first study revealing that FSHD patients showed compositional and functional GM dysbiosis. A strong association between proximal D4Z4 hypomethylation with microbial-derived SCFAs was identified. CONCLUSION: These findings suggest that GM modulation with its metabolites could be a promising strategy for interventions in FSHD management.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».