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Enregistrement W4413437218 · doi:10.1111/cge.70042

Missense Variants in the Second Transmembrane Domain of <scp>TMEM17</scp> Disrupt Its Stability and Function and Lead to a Wide Phenotypic Spectrum of Ciliopathies

2025· article· en· W4413437218 sur OpenAlexafffund
Lucile Boutaud, Chunmei Li, Candice Moncler, Laure Verlin, Meriem Garfa‐Traoré, Nicolas Bourgon, Dhruvin Akbari, Valentina Serpieri, Patrick Nitschké, Jacqueline Aziza, Cristina Matt, Enza Maria Valente, Patricia Gargallo, Charlotte Dubucs, Tania Attié‐Bitach, Michel R. Leroux, Sophie Thomas

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAgence Nationale de la RechercheMichael Smith Health Research BCInstitut des maladies génétiques Imagine
Mots-clésMissense mutationCiliopathiesPhenotypeCiliumGeneticsBiologyMutationTransmembrane domainTransmembrane proteinDomain (mathematical analysis)Cell biologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ciliopathies are rare genetic disorders characterized by significant genetic and phenotypic variability. Over 140 proteins localized to primary cilia, which are sensory organelles essential for vertebrate development, are implicated. TMEM17 encodes a transmembrane protein at the ciliary transition zone and was previously proposed as a potential ciliopathy gene, based on reports of individuals from two families with orofaciodigital syndrome type 6 (OFD6) and Joubert syndrome (JS). Here, we report two unrelated fetuses with occipital encephalocele, polydactyly, and kidney cysts, in whom exome sequencing identified a founder homozygous missense variant (Arg94Trp) in TMEM17, affecting a highly conserved residue. This expands the TMEM17-associated phenotypic spectrum to include Meckel syndrome (MKS). Comprehensive functional analyses of all known TMEM17 variants, using patient tissues/cells and a C. elegans model system, demonstrate a loss-of-function mechanism. Our study reveals severe functional consequences, including TMEM17 destabilization and mislocalization, anomalies in cilium composition and function, and abrogation of Sonic Hedgehog signaling. These experiments confirm the pathogenicity of all TMEM17 variants and underscore its essential role at the ciliary transition zone. Collectively, our findings establish TMEM17 as a bona fide ciliopathy gene, associated with a wide phenotypic spectrum ranging from viable syndromes (OFD6 and JS) to a fetal-lethal condition (MKS).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,714
Score d'incertitude au seuil0,487

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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