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Enregistrement W4413451235 · doi:10.3390/ijms26178165

Distinct Gut Microbiota Signatures Are Associated with Severity of Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease in People with HIV

2025· article· en· W4413451235 sur OpenAlexafffund
Riccardo Righetti, Felice Cinque, Bertrand Lebouché, Luz Ramos Ballesteros, Jean‐Pierre Routy, Marina B. Klein, Jason Szabo, Joseph Cox, Julian Falutz, Louis‐Patrick Haraoui, Cecilia T. Costiniuk, Alexandra de Pokomandy, Tom Pembroke, Marco Constante, Manuela M. Santos, Giada Sebastiani

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversité de MontréalUniversité de SherbrookeMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMcGill University Health Centre
Mots-clésGut floraDiseaseHuman immunodeficiency virus (HIV)Liver diseaseMedicineFatty liverMicrobiomeBiologyInternal medicineImmunologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The progression of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) to severe forms, including metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) and liver fibrosis, involves metabolic dysfunction, genetics, and gut dysbiosis. People with HIV (PWH) represent a high-risk group for MASLD, but the role of gut microbiota alterations in disease severity within this population remains poorly understood. We prospectively recruited PWH with MASLD, defined as the controlled attenuation parameter (CAP) ≥ 238 dB/m, and excluded those with viral hepatitis coinfection or alcohol abuse. Severe MASLD was defined as the presence of MASH (cytokeratin-18 ≥ 130.5 U/L) and/or significant liver fibrosis (liver stiffness ≥ 7.1 kPa). Stool samples were collected for 16S rRNA gene sequencing to characterize gut microbiota composition. Functional predictions were generated using PICRUSt. The differential abundance of bacterial taxa and predicted functions were analyzed using a generalized linear model with a negative binomial distribution. Among 34 PWH with MASLD, 18 (53%) met the criteria for severe MASLD. Microbiota profiling revealed significant differences in bacterial genera between the PWH with and without severe MASLD. Enrichment was observed in the Ruminococcus gnavus group, Negativibacillus, Holdemanella, Subdoligranulum, the Eubacterium hallii group, and Butyricicoccus, while depletion was seen in Prevotella, Alloprevotella, Dialister, Catenibacterium, the Christensenellaceae R 7 group, Clostridium sensu stricto, Olsenella, Oscillospiraceae UCG-005, Libanicoccus, and the Eubacterium siraeum group. Predicted functional pathways related to fatty acid degradation, folate biosynthesis, and amino acids metabolism did not differ between groups. MASLD severity in PWH is associated with a distinct gut microbiota signature, though not with functional pathway alterations. Microbial profiling may complement existing non-invasive biomarkers for risk stratification in this high-risk population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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