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Enregistrement W4413453067 · doi:10.1016/j.ajt.2025.08.029

Improving the histologic detection of donor-specific antibody-negative antibody-mediated rejection in kidney transplants

2025· article· en· W4413453067 sur OpenAlexaff
Luis Hidalgo, Katelynn S. Madill-Thomsen, J. Reeve, Martina Macková, Philippe Gauthier, Zachary Demko, Adam Prewett, Michelle Lee, Tarek Alhamad, Sanjiv Anand, Miha Arnol, Rajendra Baliga, Mirosław Banasik, Christopher D. Blosser, Sindhura Bobba, Daniel C. Brennan, Jonathan S. Bromberg, Klemens Budde, Andrzej Chamienia, Kevin Chow, Michał Ciszek, Nadiesda Costa, Dominika Dęborska−Materkowska, Alicja Dębska‐Ślizień, Leszek Domański, Richard Fatica, Iman Francis, Justyna Fryc, John Gill, Jagbir Gill, Maciej Głyda, Sita Gourishankar, Marta Gryczman, Gaurav Gupta, Petra Hruba, Peter Hughes, Arskarapurk Jittirat, Željka Jureković, Layla Kamal, Mahmoud M. Kamel, Sam Kant, Nika Kojc, Joanna Konopa, Dhiren Kumar, James H. Lan, Joanna Mazurkiewicz, Marius Miglinas, Thomas Mueller, Marek Myślak, Beata Naumnik, Leszek Pączek, Agnieszka Perkowska‐Ptasińska, Grzegorz Piecha, Emilio Poggio, Silvie Rajnochová­ Bloudíčková, Heinz Regele, Thomas Schachtner, Soroush Shojai, Majid L.N. Sikosana, Janka Slatinská, Katarzyna Smykał-Jankowiak, Željka Veceric Haler, Ondřej Viklický, Ksenija Vučur, Matthew R. Weir, Andrzej Więcek, Ziad Zaky, Philip F. Halloran

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Transplantation · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRenal Transplantation Outcomes and Treatments
Établissements canadiensUniversity of AlbertaSt. Paul's HospitalThe Metabolomics Innovation Centre
Organismes subventionnairesNatera
Mots-clésMedicineDonor specific antibodiesGraft rejectionKidneyKidney transplantationUrologyPathologyTransplantationSurgeryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Emerging treatments for antibody-mediated rejection (ABMR, NEJM391 (2):122-132) have increased the importance of ABMR detection when donor-specific antibody (DSA) is negative. We addressed this issue in the Trifecta-Kidney study (ClinicalTrials.gov #NCT04239703) using 3 centralized tests in 690 kidney transplant biopsies: DSA (One Lambda Inc), blood donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA, Prospera™ test, Natera, Inc), and molecular biopsy assessment (MMDx). We used an "AutoBanff 2022" algorithm to model the impact of alternative DSA interpretations on the histologic diagnosis of DSA-negative ABMR following Banff guidelines, including agreement with dd-cfDNA and molecular ABMR. Lowering MFI cutoffs for DSA positivity did not improve the detection of DSA-negative ABMR. However, simply calling all DSA as positive allowed the Banff 2022 guidelines to identify 46% more ABMR cases with no measurable conventional DSA, and per net reclassification improvement increased agreement between histologic diagnoses and both dd-cfDNA (P = 7.72E-7) and molecular ABMR (P = 7.69E-7). New ABMR cases were as strongly positive for dd-cfDNA and molecular ABMR as those found using the conventional DSA interpretation. A validation set analysis using INTERCOMEX study data (ClinicalTrials.gov NCT#01299168) confirmed these findings and found that the new DSA-negative ABMR cases identified by calling all DSA-positive had the same risk for graft loss as those found with conventional DSA interpretation. Trifecta-Kidney Study ClinicalTrials.gov #NCT04239703.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,029
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,155

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0290,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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