Proteomic signatures of podocyte injury are reflected in urinary extracellular vesicles in pediatric nephrotic syndrome
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Idiopathic nephrotic syndrome (NS) is a common glomerulopathy in children and presents with significant proteinuria. There are no reliable clinical or biochemical markers of disease relapse, or prognosis. Extracellular vesicles (EVs) are small, membrane-bound biological effectors released from stressed cells. We previously showed increases in podocyte-specific urinary EVs from children with disease relapse in NS, with numbers returning to near-zero in remission. Herein, we have expanded this work to evaluate puromycin aminonucleoside (PAN) injury by characterizing proteomic signatures of podocytes and their EVs in vitro . In addition, we performed data-independent proteomic analysis (DIA) to characterize changes in signatures of EVs from pediatric patients with active NS versus remission. Our key findings reveal PAN-injured podocytes increase large EV (LEV) secretion in vitro ; moreover, DIA uncovered changes in cellular and LEV proteomes that were also observed in urinary LEVs from patients with active disease. Urinary LEV proteomes from children with active NS were significantly different than those in remission, highlighted by 645 and 240 unique proteins associated with disease or remission, respectively. This foundational work provides the impetus for a larger, prospective biomarker study aimed at identifying EV-specific proteins associated with relapse versus remission.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».