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Enregistrement W4413471203 · doi:10.1111/febs.70236

<scp>CLEC18A</scp> interacts with sulfated glycosaminoglycans and controls clear cell renal cell carcinoma progression

2025· article· en· W4413471203 sur OpenAlexafffund
Gustav Jonsson, Maura Hofmann, Stefan Mereiter, Lauren E. Hartley‐Tassell, Masahiro Onji, Irma Sakic, Tiago Oliveira, David Hoffmann, Maria Novatchkova, Alexander Schleiffer, Josef Penninger

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesT. Von Zastrow FoundationH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsUniversität WienBundesministerium für Bildung und ForschungÖsterreichischen Akademie der WissenschaftenAustrian Science FundCanada Research ChairsMedizinische Universität WienEuropean CommissionFundació la Marató de TV3
Mots-clésGlycosaminoglycanSulfationChemistryRenal cell carcinomaCell biologyCellClear cell renal cell carcinomaCell growthCancer researchBiochemistryBiologyInternal medicineMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C-type lectins are a large protein family with essential functions in both health and disease. In cancer, some C-type lectins have been found to both promote and inhibit tumor growth, but many of the C-type lectins still remain uncharacterized. Here, we report a key role of the C-type lectin domain family 18 members (CLEC18 family) in the progression of clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). The CLEC18 family is conserved across the entire Chordata phylum, with a high frequency of duplication events in humans compared to other species. We found that CLEC18A is exclusively expressed in the proximal tubule of the kidney and the medial habenula of the brain. We further identified sulfated glycosaminoglycans as the main CLEC18A ligand, making them unique among C-type lectins. In ccRCC patients, high expression of genes in the CLEC18 family in the tumor is associated with improved survival. In mouse models of ccRCC, deletion of the mouse ortholog, Clec18a, resulted in enhanced tumor growth. Our results establish CLEC18A as a newly identified and critical regulator of ccRCC tumor growth and highlight the potential benefit of modulating expression of CLEC18 family genes in the renal tumor microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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