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Enregistrement W4413483483 · doi:10.1186/s12887-025-05554-3

Novel and optimized diagnostics for pediatric TB in endemic countries: NOD-pedFEND study protocol

2025· article· en· W4413483483 sur OpenAlexaff
Rinn Song, Else M. Bijker, Grace P. Kisitu, Emily Douglass, Emmanuel Nasinghe, Francesca Wanda Basile, Nisreen Khambati, Adam Penn‐Nicholson, Morten Rühwald, Soyeon Kim, Nathan J. Mudrak, Nandini Dendukuri, César Ugarte‐Gil, Padmini Salgame, David Alland, Susan E. Dorman, Jerrold J. Ellner, Moses Joloba, Adeodata Kekitiinwa, Gerald Agaba Muzorah, Sharley Melissa Aloyo, Sheillah Ansiima, Derek T. Armstrong, Kiranjot Arora, Sandra Ruth Babirye, Henry Balwa, Khaver Bashir, April Borkman, Eric Bugumirwa, Tatiana Cáceres, Rodrigo Calderón, Andrea Cavallini, Ted Cohen, Margaretha de Vos, Uzochukwu Egere, Christie Eichberg, Karla Giannina Ali Francia, George Haumba, David L. Hom, Pitchaya Indravudh, Farag Kakyama, Florence Kalawa, Angel Kanyange, Samuel Kasibante, Nakitto Aisha Kawwoya, Sandra V. Kik, Malik Koire, Yhanela Lagos, Nair Lovatón, John Paul Lubega, Rose Nabatanzi, Agnes Malobela, Ben J. Marais, Frank Matovu, Prossy Mbekeka, Nicolas A. Menzies, Francisco M. Mestanza, Angella N. Mirembe, Rita Makabayi Mugabe, Benedicto Mugabi, Rose Chalo Nabirye, Allen Nabisere, Stephannie Nabuduwa, Mary Nakagwa, Brenda Sharon Nakalanda, Germine Nakayita, Lydia Nakiyingi, Rose Namaganda, Claire Night, Gloria Ninsiima, Israel Odongo, Laura Olbrich, Megan Palmer, Gabriela Pérez, Rogers Kamulegeya, H. Simon Schaaf, Ian Schiller, Willy Ssengooba, Sedona Sweeney, Abner Tagoola, Ann Tufariello, Agnes Turyamubona, Luz Villa, Eric Wobudeya, Yingda L. Xie, Marjorie Yupanqui, Carlos Zamudio

Notice bibliographique

RevueBMC Pediatrics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineNodProtocol (science)Environmental healthDiabetes mellitusPathologyAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Pediatric tuberculosis is a major global public health challenge, with reliable diagnosis being a main obstacle to identifying and treating affected children. New and improved diagnostics, ideally on non-sputum samples, are urgently required, especially in the most vulnerable group of children under five years of age. Studies to date have been limited by small sample sizes and few bacteriologically-confirmed cases. Here, we describe the study protocol of the NIH-funded NOD-pedFEND study, which will be one of the largest diagnostic studies to date of children at greatest risk of tuberculosis. METHODS: In this prospective observational cohort study, we aim to evaluate existing and novel diagnostic assays, including pathogen- and host-based tests and combinations of tests. A consecutive cohort of children under five years of age with signs and symptoms of tuberculosis is enrolled in Uganda and Peru. All children undergo an extensive baseline workup with signs- and symptoms recording, microbiological reference tests, chest X-ray and tuberculin skin test for rigorous classification according to internationally recognized microbiological, composite reference and strict standards. An array of samples is collected for investigational tests. Follow-up visits are conducted at 2 weeks, 2 months and 6 months. A small cohort of healthy controls is enrolled to evaluate the specificity of selected diagnostics. The study has been approved by the relevant institutional review boards. DISCUSSION: With this large cohort study of children under five years of age, we aim to make an important contribution to the evaluation of new diagnostics for pediatric tuberculosis. By establishing a comprehensive biorepository, the study will also enable the assessment of novel tests as they become available during and after the study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,397
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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