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Enregistrement W4413612466 · doi:10.1186/s12870-025-06601-y

Natural variation and functional analysis of TaSD6 genes regulating seed dormancy in common wheat

2025· article· en· W4413612466 sur OpenAlexaff
H.W. Wang, Zhaoyu Yu, Fan Si, Wei Liu, Jinhao Chen, Renjie Wang, Wei Gao, Jiajia Cao, Chuanxi Ma, Cheng Chang, Haiping Zhang

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesJiangsu Collaborative Innovation Center for Modern Crop ProductionNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyDormancyVariation (astronomy)GeneSeed dormancyCommon wheatGenetic variationBiotechnologyBotanyAgronomyGeneticsGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bHLH transcription factor SD6 regulates rice seed dormancy. However, sequence variants of wheat SD6 homologs and their roles in seed dormancy remain unknown. Here, we cloned three wheat homologous genes of SD6 (named TaSD6-7A , TaSD6-7B , and TaSD6-7D ), and found that TaSD6-7A had abundant sequence variations, while TaSD6-7B and TaSD6-7D had no variation. Based on sequence variations in the promoter and coding regions of TaSD6-7A , we developed three molecular markers and verified their associations with seed dormancy in 160 wheat varieties. We further confirmed that the TaSD6-7 A + 1307-T allele positively regulated seed dormancy, but had no adverse effects on other important agronomic traits. Resequencing and phenotypic data indicated that the favorable haplotype TaSD6-7A HapII associated with high dormancy level was more common in landraces than in modern varieties. Additionally, we demonstrated the pyramid effects of TaSD6-7A with known dormancy-related genes in enhancing seed dormancy. Overall, this study provides novel genetic resources and molecular markers for improving PHS resistance of modern wheat varieties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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