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Enregistrement W4413670345 · doi:10.3390/cancers17172769

Ribosomal RNA Degradation (RNA Disruption) in Tumour Cells: Mechanistic Insights and Potential Clinical Utility

2025· review· en· W4413670345 sur OpenAlexafffund
Amadeo M. Parissenti, Sanaa Noubir, Laura B. Pritzker, A. Thomas Kovala, Carita Lannér, Jennifer A. Lemon, Tunde Onayemi, Sreepriya Pk, Gabriel Thériault, Maureen Trudeau, Michael Untch

Notice bibliographique

RevueCancers · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensSunnybrook Health Science CentreNOSM UniversityLaurentian UniversityHealth Sciences CentreHealth Sciences North
Organismes subventionnairesMitacs
Mots-clésRNARibosomal RNADegradation (telecommunications)Computational biologyCell biologyChemistryBiologyBiochemistryComputer scienceGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ribosome in eukaryotic cells is a macromolecular complex composed of four ribonucleic acids and over 80 proteins. This organelle facilitates protein synthesis in cells, and its activity is strongly upregulated in human cancers. Immune cells, a variety of cellular stressors and numerous structurally and mechanistically distinct anti-cancer agents have been shown to induce ribosomal RNA degradation in tumour cells in vitro and in vivo-a phenomenon we termed "RNA disruption". RNA disruption can be quantified in cultured cell lines and patient samples using the RNA disruption assay (RDA). Unlike well-known high-throughput anti-cancer drug sensitivity assays, RDA can distinguish between dying and arrested tumour cells, making it an attractive assay for anti-cancer drug discovery and development. Low tumour RNA disruption during neoadjuvant chemotherapy (as measured using RDA) is strongly associated with residual disease and reduced disease-free survival, making it a potentially valuable chemo-resistance assessment tool. High RNA disruption may also indicate chemo-responsiveness. RDA holds the prospect of being a useful tool to escalate or de-escalate neoadjuvant chemotherapy in cancer patients. Moreover, the assay's ability to predict treatment outcomes during neoadjuvant chemotherapy may permit its use in adaptive clinical trials and in drug approval by regulatory agencies. This review provides insight into the cellular processes involved in chemotherapy-induced RNA disruption. It also describes the results of clinical studies on tumour RNA disruption in cancer patients and suggests possible approaches that could be considered for the utilization of RDAs in the clinical management of breast cancer patients undergoing current neoadjuvant chemotherapy regimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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