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Enregistrement W4413757346 · doi:10.3390/genes16091016

Genotype–Phenotype Correlations in PRPH2 Retinopathies: A Comprehensive Analysis of 36 Patients from the Oxford Eye Hospital, UK

2025· article· en· W4413757346 sur OpenAlexaff
Saoud Al‐Khuzaei, Mital Shah, Arun Reginald, Morag Shanks, Penny Clouston, Robert E. MacLaren, Stephanie Halford, Samantha R. De Silva, Susan M. Downes

Notice bibliographique

RevueGenes · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypePhenotypeMedicineOptometryGeneticsBiologyOphthalmologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: To investigate genotype–phenotype correlations in PRPH2-retinopathies in a cohort of 36 patients from the Oxford Eye Hospital and report on novel pathogenic variants. Methods: Clinical data, including best corrected visual acuities (BCVA), fundus autofluorescence (FAF), and optical coherence tomography (OCT) imaging, were analysed. Genetic testing was performed using next-generation sequencing (NGS). Results: In this cohort, 26 different PRPH2 variants, including 8 novel variants, were identified. Variants were clustered in the D2 loop of the protein. A diverse range of phenotypes were observed: pseudo-Stargardt pattern dystrophy (PSPD) (47.2%), adult-onset vitelliform macular dystrophy (AVMD) (22.2%), pattern dystrophy (PD) (25.0%), atypical macular dystrophy (2.8%), and retinitis pigmentosa (RP) (2.8%). The mean age of symptom onset was 44.0 ± 14.4 years. Mean BCVA was 0.20 ± 0.54 logMAR OD and 0.14 ± 0.29 logMAR OS at baseline and 0.33 ± 0.40 logMAR OD and 0.32 ± 0.40 logMAR OS after a mean follow up duration of 6.0 ± 3.2 years (range 1–11 years). A thickened ellipsoid zone (EZ) was noted in 34/36 patients with a mean EZ thickness of 44.3 ± 11.3 µm OD and 42.7 ± 11.6 µm OS. No clear genotype–phenotype correlations were observed. Conclusions: The significant phenotypic range described in this study is consistent with the previously reported phenotypic variability in PRPH2 retinopathy and emphasises the complexity of establishing genotype–phenotype correlations in this disease. The thickness of the EZ on OCT may serve as a useful biomarker in distinguishing PRPH2 retinopathy from other phenocopies. These findings contribute to improved understanding of PRPH2 retinopathy and help inform diagnosis and genetic counselling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,329

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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