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Enregistrement W4413764906 · doi:10.1038/s43247-025-02686-3

Parameterization of photoinhibition for phytoplankton

2025· article· en· W4413764906 sur OpenAlexafffund
Mohammad M. Amirian, Zoe V. Finkel, Emmanuel Devred, Andrew J. Irwin

Notice bibliographique

RevueCommunications Earth & Environment · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal ecosystems
Établissements canadiensBedford Institute of OceanographyFisheries and Oceans CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaDartmouth CollegeSimons Foundation
Mots-clésPhotoinhibitionPhytoplanktonEnvironmental scienceEcologyBiologyBotanyPhotosynthesisPhotosystem IINutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mathematical models of photosynthesis–irradiance relationships in phytoplankton are used to compute integrated water-column photosynthetic rates and predict primary production. Models typically ignore an important phenomenon observed in most experiments: photosynthetic rate remains constant over a range of irradiances before declining due to photoinhibition. Here we develop an approach that captures both photoinhibition and this plateau. We test six new models of photoinhibition and ten more photoinhibition models from the literature against a database of 1808 photosynthesis–irradiance curves exhibiting photoinhibition. The best model improves adjusted R² by 6–37% and reduces RMSE by 15–70% compared to existing models. In the best model, photoinhibition is phenomenologically described by multiplication by a saturating function of the reciprocal of irradiance, simplifies to the widely-used Jassby & Platt photosynthesis–irradiance curve in the absence of photoinhibition, and only requires one new parameter. This photoinhibition parameter identifies the onset of photoinhibition and is the rate of decrease in photosynthetic rate at that irradiance. Simulations show that while parameter values vary up to 40% across existing models, particularly with and without photoinhibition, our representation of photoinhibition does not affect the interpretation or numerical values of parameters compared to the corresponding model without photoinhibition.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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