A Rapid Review Contrasting the Evidence on Avian Influenza A(<scp>H5Nx</scp>) Clades 2.3.4.4b and 2.3.2.1c in Humans
Notice bibliographique
Résumé
Avian influenza viruses (AIV) circulate in wild and domestic bird populations, posing an on-going risk for zoonotic transmission and virus adaptation to mammals and humans. The A(H5Nx) clades 2.3.2.1c and 2.3.4.4b currently circulating have caused sporadic infections in humans. A rapid review (RR) was conducted to contrast the evidence on infection from these clades in humans. Adhering to PRISMA guidelines, a protocol was developed a priori. The search was conducted in December 2023 for primary research articles (published and preprint) pertaining to AIV clades 2.3.4.4b or 2.3.2.1c in Scopus, PubMed and EuropePMC. Search verification and a grey literature search were also conducted in January 2024. Full-text relevance screening was conducted independently by two reviewers. Data extraction and risk of bias (ROB) assessment was conducted by one reviewer and verified by a senior reviewer. Results were reported narratively. Forty articles published between 2014 and 2023 were included in this RR. Studies found no discernible difference in the likely mode of exposure, transmission or the potential of AIV infection in humans between the two clades. Seropositivity, seroconversion and hospitalisation rates were also similar, while intensive care unit admission and fatalities were higher for A(H5Nx) clade 2.3.2.1c. Several markers of mammalian adaptation and mutations associated with increased viral replication, polymerase activity and virulence in mammals and/or mice were found in both clades. Most studies were considered to be at high ROB, while some well-designed cohort studies were at moderate ROB. This summary can be used to inform what is known about A(H5Nx) in humans for the two clades and suggests that there is on-going adaptation pressure from circulating AIVs that should be closely monitored. It is important to continue surveillance in birds, mammals and humans, conduct large epidemiological studies and develop mitigation strategies from a One Health perspective.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,050 | 0,153 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,011 | 0,010 |
| Bibliométrie | 0,035 | 0,022 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,008 | 0,009 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,025 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».