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Enregistrement W4413770254 · doi:10.1093/jac/dkaf223

Distribution and antimicrobial susceptibility profile of pathogens recovered from the bloodstream of Canadian patients: results from the CANWARD study (2007–23)

2025· article· en· W4413770254 sur OpenAlexafffundabout
Andrew Walkty, Heather J. Adam, Melanie Baxter, James A. Karlowsky, Yazdan Mirzanejad, Philippe Lagacé‐Wiens, J. Li, George G. Zhanel

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensSurrey Place CentreSurrey Memorial HospitalUniversity of ManitobaShared HealthHealth Sciences CentreManitoba Health
Organismes subventionnairesUniversity of Manitoba
Mots-clésMicrobiologyAntimicrobialBloodstream infectionBiologyDistribution (mathematics)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Bloodstream infections are associated with significant morbidity and mortality. The purpose of this study was to determine the most common pathogens causing bacteraemia among Canadian patients and to evaluate their antimicrobial susceptibility profiles. METHODS: Annually from 2007 to 2023, bloodstream isolates from patients admitted to or evaluated at Canadian hospitals were collected by sentinel laboratories (CANWARD surveillance study). Antimicrobial susceptibility testing was performed by broth microdilution. RESULTS: In total, 26 067 bloodstream isolates were obtained over 17 years of the CANWARD study (14 954 from inpatients, 11 107 from outpatients, no patient location for six isolates). The five most common pathogens were Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis and Streptococcus pneumoniae. There was little variation in pathogen distribution over time but certain pathogens were more common among inpatients (e.g. Candida albicans, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa) while others were more common among outpatients (e.g. Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae). The proportion of ESBL-producing E. coli increased from 4.5% (2007-09) to 12.7% (2019-23). The proportion of ESBL-producing K. pneumoniae increased from 2.0% (2007-09) to 7.1% (2018-23). Vancomycin susceptibility among Enterococcus faecium decreased from 84.9% (2007-09) to 69.0% (2019-23). In contrast, the proportions of S. aureus that were MRSA and P. aeruginosa that had a difficult-to-treat resistance phenotype were relatively stable. CONCLUSIONS: There has been little variation in the pathogens commonly causing bacteraemia among Canadian patients over the course of the CANWARD study, but some resistant phenotypes (e.g. ESBL-producing E. coli, ESBL-producing K. pneumoniae, VRE) are being encountered more frequently in recent years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,361
Score d'incertitude au seuil0,982

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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