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Enregistrement W4413770342 · doi:10.1093/jac/dkaf218

Characterization of methicillin-resistant <i>Staphylococcus aureus</i> in Canadian hospitals: 17 years of the CANWARD study (2007–23)

2025· article· en· W4413770342 sur OpenAlexafffundabout
Anissa Brahami, James A. Karlowsky, Melissa McCracken, George R. Golding, Kimberly A. Nichol, Melanie Baxter, Heather J. Adam, Philippe Lagacé‐Wiens, George G. Zhanel

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensShared HealthHealth Sciences CentreManitoba HealthPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesSandoz CanadaMerck CanadaUniversity of ManitobaCell Science Research FoundationPfizer
Mots-clésStaphylococcus aureusMethicillin-resistant Staphylococcus aureusMedicineMicrobiologyStaphylococcal infectionsMeticillinMicrococcaceaeAntibioticsAntibacterial agentBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: This study reviewed the patient demographic parameters, molecular characteristics and in vitro antimicrobial susceptibility testing results for MRSA isolates infecting inpatients and outpatients presenting for care to tertiary-care Canadian hospitals between 2007 and 2023. METHODS: DNA sequencing was used to generate spa types. Panton-Valentine leukocidin (PVL) genes were detected by PCR. Broth microdilution antimicrobial susceptibility testing (CLSI M7, 12th edition, 2024) was performed with MICs interpreted by CLSI M100 breakpoints (34th edition, 2024) when available. RESULTS: In total, 2697 MRSA were identified among 12734 Staphylococcus aureus isolates submitted to the CANWARD study between 2007 and 2023. The annual proportion of MRSA decreased significantly from 2007 (26.1%) to 2017 (16.0%) and then increased to 24.2% in 2023 (P < 0.0001). From 2007 to 2023, community-associated (CA)-MRSA spa types increased from 20.8% to 75.0% (P < 0.0001), while hospital-associated (HA)-MRSA decreased from 79.2% to 25.0% (P < 0.0001). The predominant MRSA spa types identified among all isolates were t002 (36.3%), an HA-MRSA genotype, and t008 (24.5%), a CA-MRSA genotype. PVL was detected in 36.0% of all MRSA isolates (76.3% of CA-MRSA; 2.7% of HA-MRSA). Percent susceptible values for all MRSA isolates were ≥99% for ceftobiprole, dalbavancin, daptomycin, linezolid, nitrofurantoin and vancomycin. Notable differences in percent susceptible values were identified for clindamycin (HA-MRSA, 38.9%; CA-MRSA, 86.9%) (P < 0.0001) trimethoprim/sulfamethoxazole (HA-MRSA, 91.4%; CA-MRSA, 98.8%) (P < 0.0001) and doxycycline (HA-MRSA, 96.6%; CA-MRSA, 98.8%) (P = 0.0003). CONCLUSIONS: The changing epidemiology of MRSA in Canadian hospitals warrants continued national surveillance efforts as a resource to support therapeutic guidelines and infection control and prevention programmes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,007
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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