Characterization of methicillin-resistant <i>Staphylococcus aureus</i> in Canadian hospitals: 17 years of the CANWARD study (2007–23)
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: This study reviewed the patient demographic parameters, molecular characteristics and in vitro antimicrobial susceptibility testing results for MRSA isolates infecting inpatients and outpatients presenting for care to tertiary-care Canadian hospitals between 2007 and 2023. METHODS: DNA sequencing was used to generate spa types. Panton-Valentine leukocidin (PVL) genes were detected by PCR. Broth microdilution antimicrobial susceptibility testing (CLSI M7, 12th edition, 2024) was performed with MICs interpreted by CLSI M100 breakpoints (34th edition, 2024) when available. RESULTS: In total, 2697 MRSA were identified among 12734 Staphylococcus aureus isolates submitted to the CANWARD study between 2007 and 2023. The annual proportion of MRSA decreased significantly from 2007 (26.1%) to 2017 (16.0%) and then increased to 24.2% in 2023 (P < 0.0001). From 2007 to 2023, community-associated (CA)-MRSA spa types increased from 20.8% to 75.0% (P < 0.0001), while hospital-associated (HA)-MRSA decreased from 79.2% to 25.0% (P < 0.0001). The predominant MRSA spa types identified among all isolates were t002 (36.3%), an HA-MRSA genotype, and t008 (24.5%), a CA-MRSA genotype. PVL was detected in 36.0% of all MRSA isolates (76.3% of CA-MRSA; 2.7% of HA-MRSA). Percent susceptible values for all MRSA isolates were ≥99% for ceftobiprole, dalbavancin, daptomycin, linezolid, nitrofurantoin and vancomycin. Notable differences in percent susceptible values were identified for clindamycin (HA-MRSA, 38.9%; CA-MRSA, 86.9%) (P < 0.0001) trimethoprim/sulfamethoxazole (HA-MRSA, 91.4%; CA-MRSA, 98.8%) (P < 0.0001) and doxycycline (HA-MRSA, 96.6%; CA-MRSA, 98.8%) (P = 0.0003). CONCLUSIONS: The changing epidemiology of MRSA in Canadian hospitals warrants continued national surveillance efforts as a resource to support therapeutic guidelines and infection control and prevention programmes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».