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Enregistrement W4413772501 · doi:10.3390/ijms26178337

Characterization and Transcriptome Analysis Reveal Abnormal Pollen Germination in Cytoplasmic Male Sterile Tomato

2025· article· en· W4413772501 sur OpenAlexfundno aff
Kosuke Kuwabara, Tohru Ariizumi

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceInstitute of GeneticsUniversity of Tsukuba
Mots-clésPollenTranscriptomeGerminationBiologyCytoplasmCytoplasmic male sterilityBotanyGeneticsGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytoplasmic male sterility (CMS) is a plant trait wherein plants cannot develop normal male organs because of the mitochondrial genes. Although the mitochondrial gene orf137 has been identified as the CMS-causing gene in tomatoes, its function remains unclear. In this study, we characterized the sterile male phenotypes and analyzed the CMS pollen transcriptome. Microscopic and calcium imaging analyses revealed that CMS pollen exhibited abnormal germination from multiple apertures, accompanied by elevated calcium concentrations and vesicle accumulation, which are typically observed in pollen tube tips. RNA-Seq analysis revealed 440 differentially expressed genes, including four pectin methylesterase inhibitor (PMEI) genes that were highly expressed in the pollen. PME activity was significantly reduced in CMS pollen, suggesting its association with abnormal pollen germination. ATP and reactive oxygen species (ROS) levels, which are key mediators of mitochondrial retrograde signaling (MRS), remained unchanged in CMS pollen, and the expression of the mitochondrial stress marker AOX1a was not elevated. These findings suggest that orf137 triggers an alternative MRS pathway independent of ATP or ROS, potentially leading to PMEI upregulation and abnormal pollen germination. Our results reveal a previously unrecognized mechanism of CMS-induced male sterility in tomatoes involving nuclear gene regulation through unconventional mitochondrial signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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