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Enregistrement W4413775499 · doi:10.1128/msphere.00441-25

Establishing an <i>ex vivo</i> porcine skin model to investigate the effects of broad-spectrum antiseptic on viable skin microbial communities

2025· article· en· W4413775499 sur OpenAlexaff
Elizabeth C. Townsend, Kui Xu, Karinda De La Cruz, Lusheng Huang, Shelby Sandstrom, Jennifer J. Meudt, Dhanansayan Shanmuganayagam, Anna Huttenlocher, Angela Gibson, Lindsay Kalan

Notice bibliographique

RevuemSphere · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensMcMaster UniversityDiscovery Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésAntisepticEx vivoMicrobiologyBiologyAntimicrobialMicrobiomePseudomonas aeruginosaBioburdenIn vivoMicrobial population biologyBacteriaMedicineBiotechnologyPathologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Incomplete antiseptic efficacy against potentially pathogenic microbial taxa places some patients at disproportionate risk for developing a surgical site infection. Laboratory models capable of interrogating the effects of antiseptics on the skin and its complex microbial communities are desperately needed to improve and better tailor antiseptic formulations. This work aims to establish an ex vivo porcine skin model to explore the impact of topical antiseptics on complex skin microbial communities and superficial skin lipids. Microbiome samples were treated with propidium monoazide to selectively evaluate DNA from viable microorganisms. Bacterial abundances were assessed via viability-qPCR and quantitative culture. Viable community populations were evaluated with 16S rRNA gene sequencing. Epidermal biopsies were collected at multiple time points for lipidomic assessment via LC/MS. The ex vivo environment promoted shifts in porcine skin lipid composition and microbial communities over the experiment’s duration. Compared to water-treated control skin, skin treated with the antiseptic chlorhexidine gluconate had significantly lower culturable counts and bioburden as determined by viability-qPCR. Compared to water-treated skin, viable microbial communities on CHG-treated skin displayed greater relative abundance of several gut-associated and Gram-negative bacterial taxa, including SMB53 , Turicibacter , Pseudomonas , and Proteus . Collectively, these findings highlight the utility of an ex vivo porcine skin system for interrogating the impacts of antimicrobial disruption on complex microbial ecosystems, and ultimately, for the future testing and development of improved antiseptic formulations. IMPORTANCE Broad-spectrum antiseptics are widely used to prevent surgical site infection and as wound cleansing agents. The impacts of such agents on beneficial microbes in the skin microbiome are understudied. Here, we describe an ex vivo skin model to test the impacts of antiseptics or other topical agents on the healthy skin microbiome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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