Évaluation d'un système de surveillance hospitalière du virus respiratoire syncytial en temps réel, Ontario, Canada, 2022–2023
Notice bibliographique
Résumé
Contexte : Le virus respiratoire syncytial (VRS) a connu une recrudescence au cours de la saison respiratoire 2022-2023, après une faible activité pendant la pandémie.Afin de suivre la saison du VRS en temps réel et de faciliter la planification des soins de santé, l'Ontario a mis en place un système de déclaration quotidienne des lits d'hôpitaux par groupe d'âge (0 à 17 ans, 18 à 64 ans, 65 ans et plus) pour les hospitalisations dues au VRS.Objectifs : Évaluer l'exhaustivité et la qualité de la surveillance en temps réel nouvellement introduite par rapport à la Base de données sur les congés des patients (BDCP) codées selon la CIM-10 en fin de saison, du 22 novembre 2022 au 31 mars 2023.Méthodes : Les hospitalisations dues au virus respiratoire syncytial provenant des deux sources de données ont été comparées à la positivité du VRS en laboratoire afin d'évaluer la concordance avec l'activité globale du virus.Une comparaison longitudinale par groupe d'âge a été évaluée par une corrélation croisée décalée dans le temps entre les données de soumission quotidienne et les BDCP, y compris les coefficients de corrélation croisée pour chaque décalage dans le temps, la limite de confiance et la valeur de corrélation la plus élevée.Résultats : Les deux sources de données ont suivi les tendances de la positivité du VRS.Les données par groupes d'âge ont montré un pic précoce d'admissions pédiatriques suivie d'un pic d'hospitalisations d'adultes et de personnes âgées.La surveillance quotidienne a systématiquement sous-estimé les hospitalisations, avec un pic de 430 lits par BDCP le 7 janvier 2023, contre 322 lits (75 %) pour la déclaration quotidienne le même jour.Les valeurs maximales du coefficient de corrélation étaient de 0,67 (tous âges confondus), 0,57 (0 à 17 ans), 0,66 (18 à 64 ans) et 0,63 (65 ans et plus).Conclusion : La mise en place d'une déclaration quotidienne pour les hôpitaux a permis de dégager des tendances précises sur les hospitalisations dues au VRS par groupe d'âge, afin d'orienter la planification des soins de santé et de la santé publique au cours de la saison.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,018 | 0,029 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».