448 A systematic review of real-world evidence on the clinical relevance, characterization, and utility of CYP2D6 biomarker testing
Notice bibliographique
Résumé
Objectives/Goals: Limited systematic analysis of real-world evidence (RWE) on pharmacogenomic (PGx) testing utility, which can help provider decision-making and avoid serious adverse effects, exists. This study explores clinical-behavioral outcomes and implementation considerations, for PGx testing in real-world clinical settings for PGx biomarker CYP2D6. Methods/Study Population: Our systematic review investigated drug–gene pairs with strong evidence (Level A, Final classification by the Clinical Pharmacogenomics Implementation Consortium [CPIC]) for CYP2D6. Search strings were deployed across Google Scholar, PubMed, Scopus, and Semantic Scholar. Papers were included only if they presented, measured, and/or described real-world clinical or patient and/or provider behavioral outcomes based on EHR or claims data assessment following PGx testing for the CYP2D6 biomarker, included PGx biomarker(s)–drug pairs with CPIC Level A, Final Evidence designations, and published in English. Study quality and bias risks were assessed using the Newcastle–Ottawa scale or A comprehenSive tool to Support rEporting and critical appraiSal…of reSearch outcomes (ASSESS) tools, where applicable. Results/Anticipated Results: Of the 218 articles identified, 25 met our inclusion criteria and explored 9 CPIC Level A, Final CYP2D6–drug pairs. Overarching qualitative themes were 1) variation in CYP2D6 biomarker testing and interpretation and 2) PGx test implementation and data considerations. CYP2D6–drug pairs were reported across four therapeutic areas (analgesia [n = 21], psychiatry [n = 17], oncology [n = 7], and gastroenterology [n = 6]) with the two most researched drugs being codeine (n = 21) and tramadol (n = 18). Six (6) articles reported PGx clinical outcomes, considered to be a “measurable change in symptoms, overall health, ability to function, quality of life, or survival outcomes” in relation to PGx testing. Discussion/Significance of Impact: Our findings indicate a need to address both inconsistent phenotype categorization and racial, ethnic, and genetic ancestry classifications and to improve EHR interoperability with PGx test results. Future RWE-PGx studies should associate dosage and regimen changes to both discrete provider choices and patient clinical-behavioral outcomes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,027 | 0,143 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,009 |
| Bibliométrie | 0,014 | 0,014 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».