Transcriptomic analysis of iron transport mutants reveals serovar-specific adaptations in <i>Salmonella enterica</i>
Notice bibliographique
Résumé
Iron is an essential mineral for almost all pathogenic bacteria, including Salmonella enterica serovar Typhimurium and Enteritidis. We have investigated the effect of the deletion of iroN, fepA, and fhu genes on the transcriptomic profiles of S. Typhimurium and S. Enteritidis strains with double ( Δ iroN Δ fepA) and triple ( Δ fhu Δ iroN Δ fepA) gene deletions and grown under iron-deficient conditions. Significant changes were observed in the expression of genes involved in virulence, stress-response, and energy metabolism in both Salmonella serovars. The pathways most affected were the tricarboxylic acid cycle, electron transport chain, and stress responses all of which were downregulated while cysteine biosynthesis was upregulated. In general, common and/or related genes were affected in the double and triple mutant strains which indicated that the additional deletion of the fhu gene affected a limited number of genes, although S. Typhimurium showed more differences than S. Enteritidis. Nevertheless, the main difference observed between the mutants of the two serovars grown under iron-depleted conditions is the enhanced upregulation of the flagellum genes in S. Enteritidis. This study reveals evidence of novel interactions between metabolic pathways and virulence under iron limitation, providing insights into adaptive strategies that may contribute to the enhanced virulence of these Salmonella serovars.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».