<i>miR‐6497‐5p</i> suppresses AcMNPV infection by targeting <i>organic cation transport protein</i> in silkworm, <i>Bombyx mori</i>
Notice bibliographique
Résumé
Baculovirus is a multipurpose virus with a wide range of applications, such as protein expression, disease therapy, biocontrol, and so forth. It is of great significance to elucidate the mechanisms of their application as biopesticides, since insect resistance to viruses limits their application. Autographa californica nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) is a representative species of α-baculovirus, and the silkworm is an ideal model organism for Lepidoptera. Exploring the interactions between the two is an important reference for elucidating the mechanism. In this study, the transcriptome of the silkworm strain p50 hemolymph was examined after 36 h of AcMNPV infection, and the data obtained were assembled and annotated with messenger RNA and microRNA (miRNA), respectively. Three miRNAs related to AcMNPV infection were obtained, including miR-6497-5p, miR-6498-3p, and miR-6498-5p. Among them, miR-6497-5p was a key miRNA for AcMNPV inhibition, and its downstream target gene, organic cation transporter protein (BmOctp), was also confirmed. Furthermore, knockdown and overexpression of BmOctp revealed that it was beneficial for viral infection, and this function was found as early as 6 h after virus infection, which may be related to the early transmembrane transport of the virus. This study is the first screening of miRNAs related to AcMNPV in silkworms, and the results provide important theoretical references for elucidating the mechanism of baculovirus-host and its potential applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».