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Enregistrement W4413843105 · doi:10.1101/2025.08.25.672084

Parasitism-mediated horizontal transfer of a functional cytochrome P450 gene entails transposon colonization in newly gained introns

2025· preprint· en· W4413843105 sur OpenAlexfundno aff
Eiichiro Ono, Kohki Shimizu, Jun Murata, Tenta Segawa, Akira Shiraishi, Ryusuke Yokoyama, Hiromi Toyonaga, Manabu Horikawa, Atsushi Hoshino, Koh Aoki

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceAkademie Věd České Republiky
Mots-clésTransposable elementHorizontal gene transferIntronGeneticsBiologyGeneColonizationMutantGenomeMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plants produce a wide variety of specialized metabolites that are typically present only in specific lineages. However, some specialized metabolites are found sporadically across distantly related plant species. While the latter cases have been explained as outcomes of convergent evolution, the molecular mechanism behind such metabolic evolution has remained largely elusive. Here, we report that parasitic dodders belonging to the genus Cuscuta accumulate sesamin, and that this accumulation may be attributed to the acquisition of enzymatically active homologs of Sesamum indicum CYP81Q1, which encodes piperitol/sesamin synthase (PSS). Phylogenetic analysis of CYP81Q homologs in Cuscuta and Grammica subgenera supports a trajectory in which ancestral Cuscuta species acquired CYP81Q from an ancestral host plant of Lamiales through horizontal gene transfer (HGT), and that the gene has been maintained during the speciation of Cuscuta . The evolution of the CYP81Q genes was accompanied by sequential intron gains, which likely involved the colonization of transposons. Experiments involving C. campestris and S. indicum suggested that expression of the host CYP81Q gene could be induced by parasitism, and physical connection to the host plant allowed the transfer of genetic elements to Cuscuta . These data suggest that parasitism-mediated HGT contributed to the transfer of a gene encoding a key enzyme in specialized lignan metabolism to Cuscuta , and that the acquired metabolic gene underwent structural modification while retaining its enzymatic function in dodders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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