Surveillance of European green crab (Carcinus maenas) and monitoring of three native crab species using different environmental DNA collection methods
Notice bibliographique
Résumé
European green crab ( Carcinus maenas ) is an invasive species of global concern due to its ecological and economic impacts. The present study explores the use of environmental DNA (eDNA) for early surveillance of European green crab on the coast of Southern Vancouver Island, British Columbia, Canada. Two field sites were selected: Sooke Basin, a known invasion site for European green crab, and Sidney Spit, located within the Gulf Islands National Park Reserve, where the species has not been reported and where Parks Canada conducts regular monitoring. We assessed three eDNA sampling approaches: filtered water, FloppE-Dip (sediment), and a 3D-printed metaprobe passive sampler that was deployed alongside baited crab traps at 15 stations. Targeted qPCR-based eDNA assays were developed and validated for C. maenas and three native crabs: red rock crab ( Cancer productus ), graceful crab ( Metacarcinus gracilis ), and Dungeness crab ( M. magister ). Among the collection methods, the metaprobe passive sampler consistently yielded the highest crab-specific eDNA concentrations and detection frequencies. At Sidney Spit, only red rock and graceful crabs were captured in traps, where eDNA using metaprobe samples yielded 100% detection frequency. In Sooke Basin, metaprobe and filtered water samples detected all four species at all stations, including high eDNA concentrations for European green crab. These results demonstrate the effectiveness of eDNA, particularly passive sampling using a 3D-printed metaprobe, for early detection of invasive crabs, supporting its integration into routine monitoring to inform timely management interventions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».