Increasing rates of ESBL-producing <i>Escherichia coli</i> and <i>Klebsiella pneumoniae</i> in Canadian Hospitals: 17 years of the CANWARD study, 2007–23
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae are major causes of infections, including urinary tract, abdominal, nosocomial pneumonia, diabetic foot and bloodstream infections. This study examines trends in their prevalence, genotypes and antibiotic susceptibility and identifies at-risk populations. METHODS: Between 2007 and 2023, bacterial isolates were collected from sentinel laboratories (CANWARD study). Identification, antimicrobial susceptibility testing and WGS were performed. Trends in incidence, resistance patterns, beta-lactamase genotypes and demographic associations were analysed using multifactorial regression and trend analysis. RESULTS: Among 11 931 E. coli and 3973 K. pneumoniae isolates, 8.4% and 5.6%, respectively, were ESBL-producers, with prevalence increasing from 2007-08 to 2021-23 (E. coli: 3.6% to 11.8%; K. pneumoniae: 2.2% to 8.0%; P < 0.001). Susceptibility among ESBL E. coli declined for amoxicillin-clavulanate (78.7% to 28.6%) but increased for gentamicin (43.5% to 70.3%) (P < 0.001). MDR among ESBL-positive E. coli declined (82.4% to 63.4%; P < 0.001) but remained stable among ESBL-positive K. pneumoniae. ESBL E. coli was associated with inpatients, respiratory specimens and males, while K. pneumoniae was linked to inpatient status and regional variations. Genotypic analysis showed increasing blaCTX-M-15 in K. pneumoniae and blaCTX-M-27 in E. coli. blaOXA-1 and blaTEM-1 were associated with MDR and first-generation β-lactam/β-lactamase inhibitor resistance. CONCLUSION: ESBL E. coli and K. pneumoniae have increased in prevalence, with evolving resistance patterns. While MDR in E. coli has declined, resistance to key antimicrobials, including sulphonamides, fluoroquinolones and first-generation β-lactam/β-lactamase inhibitors remains high. Resistance rates varied significantly by region of Canada and by inpatient status, sex and specimen type.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».