Genetic mixed-stock analysis reveals evidence of adverse effects on fall Chum Salmon tagged in the Yukon River
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Objective In 1999, radiotelemetry data suggested that 25% of the fall Chum Salmon Oncorhynchus keta migration in the Yukon River above the confluence with the Tanana River remained in the Yukon Flats, an extensive, highly braided main-stem area of the Yukon River. Our objective was to determine whether this represents Chum Salmon spawning within main-stem reaches of the Yukon Flats or a handling effect impacting fish from stocks destined for spawning areas farther upstream. Methods To assess the validity of the radiotelemetry-based stock composition estimates, we conducted genetic mixed-stock analysis on tissue samples collected from radio-tagged fish. Results Nonoverlapping CIs provided evidence that radiotelemetry and genetic stock composition estimates were different for upper Yukon River stocks. The genetic-based composition estimate (42%) for upper Yukon River stocks was greater than the radiotelemetry estimate (18%). Overlapping CIs provided no evidence that the estimates from the two methods were different for the U.S. border and upper Porcupine River. For fish last located by radiotelemetry in the Yukon Flats, genetic stock composition estimates classified most (86%) as upper Yukon River stocks. The likelihood ratio test revealed strong evidence that genetic stock composition estimates were different between fish tracked to terminal locations and those not tracked to terminal locations. A greater proportion of fish from the upper Yukon River was present in the mixture of fish that did not reach terminal locations, whereas a greater proportion of fish from the U.S. border was present in the terminal mixture. The assignment test revealed strong evidence that radiotelemetry samples had a higher proportion of misassignments than known-origin samples. Most (64%) misassignments involved fish that were genetically assigned to the upper Yukon River. Conclusions These results indicate that upper Yukon River fish in the radiotelemetry study suffered from residual handling effects and were less likely to reach their natal spawning grounds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».