Uncovering the Heterogeneity and Ontogeny of Mouse Thymic Macrophages Reveals an Unexpected Early Checkpoint Role
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Thymic macrophages (TMs) maintain tissue homeostasis by clearing the large numbers of apoptotic cells generated during T cell development, but how TM heterogeneity relates to their developmental origin and role in thymocyte maturation remains incompletely understood. Using complementary flow-cytometric, single-cell transcriptomic, and genetic approaches, we resolved two major TM populations corresponding to TIMD4 + cortical and CX3CR1 + medullary/cortico-medullary macrophages. TIMD4 + VCAM1 + TMs displayed a prominent efferocytosis and apoptotic-cell-clearance program, whereas TIMD4 − VCAM1 + TMs were enriched for antigen-presentation and interferon-response pathways. Fate mapping revealed unequal progenitor contributions to these populations, and CCR2 deficiency selectively reduced TIMD4 − VCAM1 + TMs and thymic monocytes, supporting ongoing input from circulating precursors. Exploratory pseudotime analysis further identified a transcriptional continuum from Ly6c2 + Ccr2 + monocytes toward macrophage states. Using MaFIA fetal thymic organ cultures, AP20187-mediated depletion of Csf1r- expressing myeloid cells reduced CD4 + CD8 + thymocyte differentiation and produced a coordinated accumulation of DN3 cells, loss of DN4 cells, and reduction in CD27 expression. These convergent changes identify the DN3-to-DN4 transition as a developmental stage that requires an intact Csf1r -expressing myeloid compartment, and establish a functional connection between the thymic myeloid niche and early αβ T cell development. Together, our study refines the phenotypic and developmental organization of mouse TMs and reveals a previously under-appreciated requirement for myeloid-cell support during progression through the β-selection checkpoint.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».