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Enregistrement W4413897370 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-cjbf3

Impact of Solvation on the Photoisomerization Mechanism of Oxindole Switches with Electron-Donating Substituents

2025· article· en· W4413897370 sur OpenAlexaff
Miquel Huix‐Rotllant, Abdul Qadeer, Daniel Roca‐Sanjuán, Javier Segarra‐Martí, Cheol Ho Choi

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiquePhotochromic and Fluorescence Chemistry
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesMinistry of Science and ICT, South KoreaNational Research Foundation of KoreaAgence Nationale de la RechercheNational Research Foundation
Mots-clésPhotoisomerizationSolvationOxindoleMechanism (biology)ChemistryPhotochemistryElectronComputational chemistryIsomerizationOrganic chemistryPhysicsCatalysisSolventQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular photoswitches that undergo Z/E photoisomerization are fundamental components of light-driven molecular machines. Their efficiency is determined by ultrafast isomerization dynamics and high quantum yields, both of which are strongly modulated by the solvent environment. In this work, we examine two protonation states of an oxindole-based photoswitch in methanol. Using a combination of quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) simulations with semi-empirical and high-level electronic structure methods, we compute radial distribution functions, isomerization free energy barriers, absorption spectra, and nonadiabatic dynamics in solution. We find that the deprotonated oxindole establishes stronger hydrogen bonds with methanol, whereas the protonated form adopts a pre-twisted conformation in solution. Nonadiabatic dynamics reveal that the weaker hydrogen bonding of the protonated state permits coherent isomerization, in contrast to the deprotonated form, where solvent fluctuations exert a stronger influence on individual trajectories. These findings clarify how solvent interactions govern the photoisomerization pathways of molecular photoswitches and inform the design of light-driven molecular machines, thereby enabling precise control of their operation in the condensed phase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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